ThinkPHP基于MVC（Model-View-Controller，模型-視圖-控制器）模式，不過均支持多層（multi-Layer）設計。
模型（Model）層：默認的模型層由Model類構成，但是隨著項目的增大和業務體系的復雜化，單一的模型層很難解決要求，從3.1開始推出了多層Model的支持，設計思路很簡單，不同的模型層仍然都繼承自系統的Model類，但是在目錄結構和命名規范上做了區分，例如在某個項目設計中需要區分數據層、邏輯層、服務層等不同的模型層，我們可以在項目的Lib目錄下面創建Model、Logic和Service目錄，把對用戶表的所有模型操作分成三層：
數據層：Model/UserModel 用于定義數據相關的自動驗證和自動完成和數據存取接口
邏輯層：Logic/UserLogic 用于定義用戶相關的業務邏輯
服務層：Service/UserService 用于定義用戶相關的服務接口等
而這三個模型操作類統一都繼承Model類即可，這樣對用戶數據的操作就非常清晰，在調用的時候，也可以用內置的D方法很方便的調用：
D('User') //實例化UserModel
D('User','Logic') //實例化UserLogic
D('User','Service') //實例化UserService
對模型層的分層劃分是很靈活的，開發人員可以根據項目的需要自由定義分層。
視圖（View）層：由模板和模板引擎組成，在模板中可以直接使用PHP代碼，模板引擎的設計會在后面講述，通過驅動也可以支持其他第三方的模板引擎。視圖的多層可以簡單的通過目錄區分，例如：
Tpl/default/User/add.html
Tpl/blue/User/add.html
控制器（Controller）層：ThinkPHP的控制器層由核心控制器和業務控制器組成，核心控制器由系統內部的App類完成，負責應用（包括模塊和操作）的調度控制，包括HTTP請求攔截和轉發、加載配置等，業務控制器則由用戶定義的Action類完成。3.1版本開始增加了多層業務控制器的支持。其實現原理和模型的分層類似，例如業務控制器和事件控制器：
Action/UserAction //用于用戶的業務邏輯控制和調度
Event/UserEvent //用于用戶的事件響應操作
UserAction負責外部交互響應，通過URL請求響應，例如 http://serverName/User/index,而UserEvent 負責內部的事件響應，并且只能在內部調用
A('User','Event');
所以是和外部隔離的。多層控制器的劃分也不是強制的，可以根據項目的需要自由分層。控制器分層里面可以根據需要調用分層模型，也可以調用不同的目錄的視圖模板。
同時，R方法也可以支持多層控制器的調用了，增加了第三個參數表示控制器的層名稱，例如：
R('User/register',array(15),'Event');
表示調用UserEvent控制器的register方法，并傳入參數15.
在MVC三層中，ThinkPHP并不依賴M或者V，甚至可以只有C或者只有V，這個在ThinkPHP的設計里面是一個很重要的用戶體驗設計，用戶只需要定義視圖，在沒有C的情況下也能自動識別。
